13. Vorlesung WS 2005/06 Software-Werkzeuge der Bioinformatik29 Smith-Waterman-Algorithmus Smith-Waterman ist ein lokaler Alignment-Algorithmus. SW is
{"Image DocumentName": "Smith-Waterman-Algorithmus", "Image ImageDescription": "Smith-Waterman ist ein lokaler Alignment-Algorithmus. SW ist eine sehr einfache Modifikation von Needleman-Wunsch. Lediglich 3 \u00c4nderungen: die Matrixr\u00e4nder werden auf 0 statt auf ansteigende Gap-Penalties gesetzt. der maximale Wert sinkt nie unter 0. Pointer werden nur f\u00fcr Werte gr\u00f6sser als 0 eingezeichnet. Trace-back beginnt am gr\u00f6sseten Wert der Matrix und endet bei dem Wert 0. ELACAN. ELICAN. C. O. E. L. A. N. T. H. P I What database sequences are most similar to (or contain the most similar regions to) my previously uncharacterised sequence? Searching a data base needs to be fast and sensitive but the two objectives. counteract each other. and has a high sensitivity for detecting distant sequence relationships between a query sequence and a database. Input=seq. Output= list of seq that match query sequence.", "Image XResolution": "37", "Image YResolution": "37", "Image ResolutionUnit": "Pixels/Centimeter", "Image Software": "SlidePlayer", "Image YCbCrPositioning": "Centered"}